La MFREO de Marie-Galante a été la première MFREO à voir le jour dans l'archipel guadeloupéen. Elle a été créée en 1969 sous statut associatif, de la volonté de quelques agriculteurs de l'île ayant vu la nécessité de former des jeunes afin de répondre aux besoins du territoire. Située à Pirogue, elle a suivi l'évolution du milieu purement agricole. Au fil des ans, elle a perdu l'habilitation et par la même, les formations initiales. Elle s'est donc tournée vers la formation continue puis l'apprentissage.

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Après 44 ans d'existence, la MFREO a dû fermer ses portes le 23 mai 2013 suite à de nombreux problèmes administratifs et économiques.

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Cette structure avait participé à la création des autres MFR de Guadeloupe, notamment la MFREO de Vieux-Habitants en 1980.

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C'est donc naturellement que les administrateurs de la MFREO de Vieux-Habitants se sont portés volontaires pour aider à remettre sur pied la MFREO de Marie-Galante. Pour cela, ils ont créé une annexe de la Côte Sous le vent qui a évolué vers une association indépendante créée le 20 janvier 2016.

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Après deux années de rattachement en tant qu'annexe de la MFR de la Côte Sous le Vent, une nouvelle association MFREO île de Marie-Galante a vu le jour le 20 janvier 2016.

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Elle est née de la volonté des familles, des professionnels, des appuis politiques de l'île ainsi que la fédération des MFREO de Guadeloupe. Tous ont vu la nécessité d'offrir aux jeunes de Marie-Galante des formations adaptées aux besoins socio-économiques du territoire pouvant faciliter leur insertion dans la vie active.